A série vai pegar de onde parou a última temporada e continuar a seguir o caminho dos estudantes NYADA e as crianças do New Directions. O ano escolar vai continuar no McKinley High, onde a vitória do clube do coral nas Regionais vai colocá-los no caminho para a possível vitórias nas Nationals. Enquanto isso, em Nova York, vamos descobrir se Rachel aterra o papel principal em sua primeira produção da Broadway e o que Blaine planeja para sua proposta de Kurt. Dois primeiros episódios da temporada contará com canções dos Beatles. Uma homenagem ao personagem de Cory Monteith, o Finn Hudson, será feito. Além de uma um episódio baseado na rixa entre os fãs de Gaga e Katy Perry, a 5ª temporada de Glee terá um episódio em homenagem ao cantor Billy Joel. Uma curiosidade é que o décimo segundo (12) episódio dessa temporada marca o centésimo (100) da série, e neste teremos a presença de vários antigos personagens, além de músicas já gravadas em Glee, escolhidas por uma votação no site oficial da série.2 Nas últimas quatro temporadas, o líder do Glee Club foi Will Schuester está casado com a Emma Pillsbury. O coração de Mr. Schuester está no lugar certo e ele está determinado a ajudar as crianças em todos os aspectos da vida, mas a cada passo que ele deve lutar com sua rival, Sue Sylvester (atriz vencedora do Emmy Jane Lynch), a treinadora de cheerleading conivente com um bebé recém-nascido. Esse ano, o New Directions conta com Unique Adamas, Marley Rose, Jake Puckerman, Kitty Wilde, Ryder Lynn, Blaine Anderson, Sam Evans, Artie Abrams e Tina Cohen-Chang. Entrou também para o elenco de Glee a líder de torcida Bree. A partir do episódio 100 de Glee, "O episódio marco" – que será dividido em duas partes e irá ao ar nos dia 18 e 25 de março – mostrará Sue Sylvestre acabando com o New Directions, causando a partida de Mr. Shue. Uma grande parte do elenco original e estrelas convidadas retornarão para dizer adeus ao personagem de Morrison, entre eles estão Dianna Agron, Amber Riley, Mark Salling, Heather Morris e Harry Shum Jr. Depois do episódio, os episódios terão NYC como núcleo, fazendo com que Blaine), Artie  e Sam  se juntam a Rachel, Kurt e Santana. Mais pra frente Mercedes  se muda para NYC e acaba dividindo seu apartamento no Brooklyn com Blaine (depois de várias discussões e brigas com Kurt, ele acha melhor se mudar para salvar o casamento dos dois) e Sam (com quem volta a ter um caso). A Grande estréia de Rachel em Funny Girl finalmente acontece e com isso consegue ganhar uma grande popularidade imensa em NYC, Will e Sue acabam parando na grande cidade grande para ver a estréia de Rachel, mas o filho de Will com Emma nasce um pouco antes da estréia, isso faz com que Will tenha que voltar as pressas para Ohio. Blaine consegue ser apadrinhado por uma grande socialite nova yorkina, isso faz com que Kurt se morda de ciúmes e "quase" acaba tudo entre eles. Mercedes está finalizando seu álbum de estréia mas precisa de um novo ritimo e cabe a ninguém menos que Santana Lopez para a lhe ajudar nessa missão. No último episódio, The Untitled Rachel Berry Project (O Projeto Sem Título de Rachel Berry), Brittany volta para ficar com Santana, mas Santana infelizmente não se encontra, Mercedes apresenta seu novo single e Brittany se junta a ela na sua primeira turnê como dançarina, Blaine e Kurt se apresentam para as grandes socialites de NYC e Rachel consegue o roteiro do piloto de sua série na TV e vai fazer com que o sucesso que já tinha em NYC vire um sucesso mundial.